貢嘎山地區，在大地構造上，處於青藏板塊與揚子板塊交接帶的西緣。由於三迭紀晚期的印支運動和白堊紀末至第三紀新世中期，地史上著名的燕山運動的最後一帶，使本區由古海中褶皺隆起，從而奠定了貢嘎山地區大地貌的骨架。隨後，由於伴有大規模火山噴發的岩漿侵入的上托作用，到中新世紀末期，貢嘎山主峰才高聳於群峰之上。在這段滄海桑田的巨變中，相繼產生了一組南北向籪裂帶和晚一些出現的北西向與北東向兩組籪裂帶。因為這兩組籪裂的交織，而形成了南北狹長，狀若“金字塔”的菱形斷塊。這個斷塊中央最高部位，即今日的貢嘎山主峰；在這一隆起過程中，在菱形斷塊的周圍，並伴有斷陷地帶的形成，後來即發育成河流。
本區地層十分複雜。並以貢嘎山的主脊線為界，東、西兩面差異極大。總的特點是：東坡以古生代深度變質岩及古老的岩漿為主；西坡主要是中生代三迭紀輕變質岩類組成。
二迭紀地層是貢嘎山東坡的主要地層。出露的母岩主要為含各種雲母的石英片岩，以及變質砂岩、紫紅色板岩、灰岩等。自南而北，岩性變化很大。除二迭紀地層外，尚有出露不全，分布零星的震旦紀地層。出露有流紋岩、鈣質千枚岩、石英岩和志留紀的鈣質板岩、綠泥石片岩等。在本區東南部及康定、冷磧等地，還有少量岩性變化、極大的泥盆紀地層。主要出露灰白色至深灰色塊狀白雲岩、岩質千枚岩、板岩，在康定一帶還可見黑色岩質、硅質絹雲母板岩夾千枚岩等岩類。除上述深度變質岩類外，東坡還有大量的岩漿岩。分布區可以磨西籪裂為界，以東分布著大量的元古代古老的岩漿岩，如斜長花崗石，石英閃長岩等。而磨西籪裂以西，主要為中生代印支—喜山期之岩漿層，岩體多岩貢嘎山主脊線東、西兩側分布。主要出露各種花崗岩、石英閃岩等。這些岩層，經地質部門實測的絕對年齡，僅為5500—800萬年之間，而較磨西籪裂以東的岩漿岩“年輕”得多。由於貢嘎山東坡岩性堅硬，故岩石抗風化能力較強。
貢嘎山的西坡，主要以三迭紀上統地層為主。出露的岩層有灰黑色板岩、砂岩和少量頁岩、泥岩等，並多呈瓦層。此外，還有部分印支—喜山期的岩漿岩，如黑雲母花崗石和二長花崗岩，僅分布於玉龍溪斷陷谷以東至主脊線的狹長地帶，而玉龍溪以西，則絕大部分為三迭紀地層。整個西坡，因為母岩岩性較鬆軟，故抗風化能力較弱。
自第四紀以來200萬年間，是整個青藏高原最強烈的隆起時期。貢嘎山地區，由於受新構造運動的影響，在這一時期隆起的幅度最大。根據本區現存古岩溶遺跡和最低與最高一級夷平面的海拔高度推算，第四紀以來的累積隆起量達300—5200米，並主要表現為差異性的斷塊抬升。強烈的新構造運動。使老籪裂普遍復活，並圍繞著貢嘎山菱形斷塊強烈地活動。在這些復活了的籪裂帶上，出露大量溫泉，成為本區寶貴的地質資源。同時，地震活動強烈而又頻繁。也是古今以來，著名的高強度、高頻率的地震活躍區。新構造運動的另一作用是層狀地貌十分發育，表現在河谷與山頂分別發育有多級階地和夷平面。而且冰磧物、沉積物和因重力作用而產生的堆積物，如老滑坡堆積和崩塌堆積等，在區內隨處可見，並以東坡最明顯。
隨第四紀冰期的到來，貢嘎山地區的山谷冰川作用也十分活躍。根據研究，這裡曾有過三次冰期和兩次間冰期，並留下了大量的遺跡，如古冰川谷、古冰鬥、巨大的冰川漂礫和林立的角峰與鋸齒狀的刃脊，以及因此而發育了較多的高山湖泊。如伍須海子、豬腰子海、九海子等。這些湖泊，對接納冰川融雪，調節高山局部地區的氣候可起到一定作用。
貢嘎山地區地貌的另一特點是現代冰川十分發育。因此，冰雪侵蝕與寒凍的作用強烈。目前，東坡的現代雪線為海拔4900—5000米，西坡為5100—5200米。在現代雪線以上，終年冰雪覆蓋，冰川圍繞貢嘎山主峰發育。如東坡的海螺溝冰川、燕子溝冰川；西坡的貢巴冰川；南坡的巴王溝冰川和北坡的加則拉溝冰川等最有名。這些冰川地區都具有降水豐沛、消融強烈、溫度高（一般冰內溫度為0℃、冰面流水溫度0.3℃左右）、冰舌末端伸入森林帶中等特點。 然而，這些冰川近期卻處於退縮階段。據中國科學院成都地理研究所，1980年對燕子溝冰川考察研究後推算，1930—1966年間，該冰川後退約3公里，每年平均後退約100米；1996—1980年間，後退約650米，每年平均後退40—50米。現代冰川的後退，一方面和大範圍氣候變遷密切相關，而另一方面，也和大面積的砍伐森林等墾殖活動有關。因此，這將使雪線升高，植物賴以生存的水、熱條件也將發生改變。水源減少，使森林面積縮小，草原面積逐漸擴大。這是值得重視和研究的問題。
處於東坡的燕子溝景區和海螺溝景區，實際上是以發源於雪門坎南側、自北向南偏東方向於得妥匯入大渡河的磨西河流域範圍為貢嘎東坡景觀區域的範圍，而磨西河流域的北部、中部為燕子溝景區，南部為海螺溝景區。磨西河流域的特點是西面的匯水面大、坡度大、支流長、流量大；東面的匯水面小、支流短、流量小。西面的支流主要包括南門關溝、燕子溝、海螺溝。
燕子溝景區的地貌特點為：屬於貢嘎山東坡嶺谷高差巨大而陡峭的高山峽谷地貌。地貌垂直自然帶譜明顯和完整，分為河谷季風亞熱帶—山地季風暖溫帶—亞高山寒溫帶—高山亞寒帶—高山寒凍風化帶—極高山永久冰雪帶，共六個序列。以磨西河流域的北部、中部含南門關溝、燕子溝兩條重要支流為景區範圍。景區最高海拔點為貢嘎主峰，高程7556米；最低點為河谷的瀘定縣醫院北側，海拔高程為1770米。景區地勢西高東低，北高南低，磨西河河谷地帶是景區的最低地帶，整體地形圍繞磨西河及其支流展布。景區沿磨西河河谷分布有大量的河谷台地，其中以南門關溝口入南至海螺溝溝口的帶狀台地面積最大，達8平方公里左右。此外，支流的河谷如燕子溝也分布了一些河谷台地，只是規模較小。磨西河的上游地帶，分布有幾個小型高山湖泊，其中以豬腰子海子為代表；燕子溝的藥王廟，有溫泉出露。
子梅埡口看貢嘎山
蜀山之王
